Ki sa ki sekans genomik antye ak sekans gè?

Sa yo se metòd yo itilize pou evalye ak sekans ADN nan genomik yon òganis nan yon sèl fwa.

Resanblans

Resanblans ant sekans genomik antye ak sekans fizi gen ladan;

• Tou de patisipe nan sekans fragman asid dezoksiribonukleik
• Tou de teknik enplike fwagmantasyon jenomik
• Tou de teknik itilize dijitalizasyon epi yo baze sou òdinatè
• Tou de teknik jwe yon wòl kritik nan syans rechèch ak nan dyagnostik molekilè

Sekans Genom antye

Sekans Whole-genome aka (WGS) se yon teknik detaye pou mennen ankèt sou tout sekans asid genomik Deoxyribonucleic nan yon selil nan yon sèl fwa.

Sekans Whole-genome te vin disponib apre pibliye Pwojè a Genom Imèn, ki te bay referans a pou sekans genomic imen.

Fizi chas sekans

Sekans fizi de gè enplike nan planifye divize asid dezoksiribonukleik kase sekans asid dezoksiribonukleik nan anpil ti fragman ak Lè sa a, rasanble yo ankò (sekans lan) pa n ap kalkile sou rejyon yo nan sipèpoze la.

Diferans ant sekans genom antye ak gè

Deskripsyon

Sekans Genom antye

Sekans genomik antye (WGS) se yon pwosesis aranjman yon sèl etap. Nan teknik sa a, genomik la antye (haploid mete kwomozòm nan yon mikwo-òganis) taye pran plas an premye. Aprè sa, chak ti fragman frajil sa yo sibi pwosesis aranjman owaza. Yon fwa ke aranjman sa a oswa sekans konplete, analiz la pran plas li. Gen eliminasyon pwosesis sekans sipèpoze nan moman evalyasyon aranjman / sekans yo, epi evalyasyon an se pa yon teknik òdone. Pakonsekan, tout pèp la nan sekans se yon pwosesis mwens siksè ak efikas. Sepandan, pwosesis la nan sekans genomic antye se pi rapid, ak evalyasyon an nan genomic an antye (haploid mete kwomozòm nan yon mikwo-òganis) ka pran plas nan yon egzanp sèl.

Fizi chas sekans

Sekans fizi se yon metòd laboratwa pou evalye sekans asid Deoxyribonucleic nan materyèl jenetik yon òganis (genomic). Teknik la se enklizif nan kraze materyèl jenetik òganis la nan ti fragman asid Deoxyribonucleic ki reprezante sekans endividyèl elèv yo.

Itilizasyon

Sekans Genom antye

• Nouvo maladi ki fèt ak pedyatrik - Dedwi varyant estriktirèl ak analiz zòn ekzonik ki pa byen pran.
• Esè dwòg ak farmakojenomik - WGS ofri benefisye mekanis devan-fen pou esè klinik, ki ede nan klasifye moun (pasyan) sou baz repons yo nan medikaman an oswa dwòg anba etid la.
• Varyasyon regilasyon ak eQTLs
• Kalite Rimè ki ra - WGS se metòd ki kòrèk la mennen ankèt sou timè ki ra. Teknik la ede nan etidye ak kaptire seri a konplè nan mitasyon, ki soti nan chanjman baz sèl (yon sèl baz nan asid la Deoxyribonucleic diferan de baz la abityèl nan ki pozisyon) nan pi gwo rearanjman kwomozòm, nan yon eksperyans yon sèl-fwa.
• Klan Genomics - Jeneyalojik Maladi Fanmi - wobinèt jeneyaloji multiplex soti nan fanmi ki afekte nan pwoblèm jenetik.
• Gwo kòwòt ak fenotip anpil

Fizi chas sekans

• Envestige sekans asid Deoxyribonucleic nan genom yon òganis lan.
• Metòd efikas nan sekans endirèkteman asid ribonukleik oswa pwoteyin (atravè ankadreman lekti louvri yo)
• Metòd ki pi pi pito pou tout lòt kalite seri haploid nan kwomozòm nan yon sekans mikwo-òganis tou. Ansanm total haploid nan kwomozòm nan anpil òganis, - bèf la, poul, rat, plant Arabidopsis thaliana, pufferfish, ak anpil òganis mikwoskopik yo te sekans swiv teknik sa a.
• Toupre-fini ak prèske final de novo asanble nan jnom mikwòb nan trè mwens jou
• Pouvwa a sekans gwo, genomik konplèks
• GS FLX + Sistèm li longè jiska 1 kb
• Fè asanble ibrid

Etap

Sekans Genom antye

• Jenere sekans li dirèkteman nan yon jenerasyon antye (haploid mete kwomozòm nan yon mikwo-òganis) depo
• Aplikasyon nan metòd enfòmatik reasanble nan etap sèl
• Itilize pou vole fwi (Drosophila Melanogaster) ak pa Celera Genomics (devlope 1998) pou genomik imen (haploid mete kwomozòm nan yon mikwo-òganis)

Fizi chas sekans

• Etap nan sekans fizi gen ladan;
• Preparasyon Bibliyotèk
• Sekans fragman cfDNA yo
• Fragman konte
• Aliyman sekans
• Estatistik analiz, ak rapò.

Rezime

Pwen yo nan diferans ant sekans genomic antye ak sekans gè yo te rezime kòm anba a:

Sekans antye jenom vs sekans fizi